Ириклинское водохранилище, самый крупный искусственный водоем Южного Урала, было построено в 1949-1957 годах с целью гарантированного водоснабжения восточной и центральной частей Оренбургской области.
Его заполнение началось 17 апреля 1958 года и завершилось 8 мая 1966 года, когда впервые была достигнута проектная отметка — 245 метров над уровнем моря. Гидроузел водохранилища образован глухой смешанно-набросной плотиной и береговым бетонным водосбросом, где размещена гидроэлектростанция мощностью 30 мегаватт.

Управление эксплуатации организовано Министерством мелиорации и водного хозяйства РСФСР 1 октября 1980 г.
С 24 ноября 1999 года Управление стало Федеральным государственным учреждением.
Только за первые 20 лет Управлением создана производственная база общей площадью 1,2 гектара (автотракторная стоянка, трассовая мастерская с оборудованием, материально-технический склад, гараж для легковых автомобилей); пирс площадью 0,5 гектара; аналитическая лаборатория, контролирующая качество воды, поступающей в водохранилище, и в самом водоеме.

Основными целями деятельности ФГУ «УЭИВ» являются:
организация в пределах своей компетенции реализации мероприятий по изучению, рациональному использованию и охране водных ресурсов, восстановлению водных объектов, предупреждению и ликвидации вредного воздействия вод на территории Оренбургской области и на иных территориях Российской Федерации;
эксплуатация находящихся в оперативном управлении ФГУ гидротехнических сооружений и водохозяйственных систем;
информационное обеспечение Нижне — Волжского бассейнового водного управления Федерального агенства водных ресурсов по вопросам состояния и эксплуатации гидротехнических сооружений и водохозяйственных систем в зоне деятельности ФГУ;
сбор, анализ и обобщение материалов по водохозяйственным и водоохранным мероприятиям;
выполнение работ, связанных с ведением государственного водного кадастра и государственного учета использования вод в зоне деятельности ФГУ в порядке, установленным законодательством РФ;
обеспечение в установленном порядке ведения государственного мониторинга поверхностных водных объектов, водохозяйственных систем и сооружений;
участие в подготовке заключений по предпроектной и проектной документации на строительство объектов, влияющих на состояние водных объектов и их водоохранных зон;
проведение лабораторных исследований качества вод и донных отложений;
организация конференций, семинаров, выставок и еще ряд других мероприятий.